La laguna se hunde 3,8 milímetros cada año por un leve movimiento vertical, según los estudios geológicos
Las características del subsuelo y la existencia de una subsidencia (un movimiento descendente de 3,8 milímetros al año) pueden condicionar la construcción de un túnel submarino en el Mar Menor para enlazar La Manga con San Javier, como proyecta el Gobierno regional. Para tener seguridad y estabilidad, el subterráneo tendría que perforarse a una cota de 40 metros bajo el nivel del mar, según ha explicado Tomás Rodríguez Estrella, profesor titular de Geodinámica Externa e Hidrogeología de la Universidad Politécnica de Cartagena, autor de un trabajo sobre la geología de la laguna publicado en 2009 por el Instituto Euromediterráneo del Agua.
